Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm15094-201ENSMUST00000118394 1131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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