Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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Sh3bp1P55194 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sh3bp1P55194 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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