Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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PtpreP49446 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtpreP49446 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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