Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hdac5Q9Z2V6 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms