Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SrfQ9JM73 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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