Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Smg9Q9DB90 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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