Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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