Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Cldn16Q925N4 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Cldn16Q925N4 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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