Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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Pggt1bQ8BUY9 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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