Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Cpne9Q1RLL3 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cpne9Q1RLL3 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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