Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxc4Q08624 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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