Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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Sh3bp2Q06649 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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Sh3bp2Q06649 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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Sh3bp2Q06649 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms