Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Hoxd1Q01822 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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