Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PtpreP49446 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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