Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PdgfrbP05622 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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