Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CntfrO88507 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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