Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ptpn9O35239 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ptpn9O35239 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms