Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gm379J3QQ19 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms