Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn6Q9Z262 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms