Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Col4a3Q9QZS0 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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Col4a3Q9QZS0 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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Col4a3Q9QZS0 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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Col4a3Q9QZS0 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Col4a3Q9QZS0 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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