Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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