Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Ccdc18Q640L5 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc18Q640L5 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms