Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms