Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ptchd1Q14B62 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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