Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cntn3Q07409 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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Cntn3Q07409 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Cntn3Q07409 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cntn3Q07409 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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