Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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