Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm20108-201ENSMUST00000219977 153 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm22458-201ENSMUST00000082576 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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