Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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Hoxb1P17919 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxb1P17919 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxb1P17919 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxb1P17919 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxb1P17919 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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