Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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DffaO54786 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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DffaO54786 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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DffaO54786 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DffaO54786 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DffaO54786 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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