Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Cldn4O35054 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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