Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MttpO08601 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
MttpO08601 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
MttpO08601 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
MttpO08601 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
MttpO08601 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
MttpO08601 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms