Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Lrp3E9Q1T6 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms