Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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