Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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