Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
OtofQ9ESF1 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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