Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Nebl-202ENSMUST00000124270 8079 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RpainQ9CWY9 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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