Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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Ercc8Q8CFD5 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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Ercc8Q8CFD5 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Ercc8Q8CFD5 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ercc8Q8CFD5 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ercc8Q8CFD5 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ercc8Q8CFD5 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ercc8Q8CFD5 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ercc8Q8CFD5 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ercc8Q8CFD5 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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