Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms