Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm24637-201ENSMUST00000158674 85 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Runx1t1-202ENSMUST00000098256 3317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxd11P23813 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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