Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccl20O89093 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms