Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cldn4O35054 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cldn4O35054 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms