Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Gm3893E9Q1I1 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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Gm3893E9Q1I1 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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Gm3893E9Q1I1 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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Gm3893E9Q1I1 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Gm3893E9Q1I1 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms