Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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