Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cln8Q9QUK3 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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