Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Col5a3Q9JLI2 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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