Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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Cldn22Q9D7U6 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Cldn22Q9D7U6 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Cldn22Q9D7U6 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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Cldn22Q9D7U6 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn22Q9D7U6 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn22Q9D7U6 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn22Q9D7U6 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn22Q9D7U6 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Cldn22Q9D7U6 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn22Q9D7U6 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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