Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Ccdc47Q9D024 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Ccdc47Q9D024 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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