Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Pggt1bQ8BUY9 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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Pggt1bQ8BUY9 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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Pggt1bQ8BUY9 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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