Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NipblQ6KCD5 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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