Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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Rnf180Q3U827 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Rnf180Q3U827 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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